Pod patronatem redakcji organizowane są doroczne konferencje naukowe. Wystąpienia prelegentów stanowią podstawę do przygotowania działów tematycznych czasopisma w kolejnym roku.
W dniach 26-28 listopada 2025 r. odbyła się 14. międzynarodowa konferencja naukowej z cyklu „Need to Know”, poświęcona historii wywiadu oraz kontrwywiadu w XX wieku. W pierwszym dniu obrady toczyły się w sali konferencyjnej w zabytkowej siedzibie krakowskiego Oddziału IPN przy ul. Stefana Czarnieckiego 3. W pozostałe dwa dni w hotelu Golden Tulip Kraków-Kazimierz przy ul. Krakowskiej 28.

Temat tegorocznej edycji to „W świecie krzywych zwierciadeł. Wywiad i dezinformacja” /„In a world of mirrors. Intelligence and Disinformation”. Wielu wciąż uważa Zimną Wojnę za apogeum zarówno wojny wywiadów, jak i kampanii dezinformacyjnych. W ostatnich latach temat stał się na powrót bardzo aktualny, a to przez wzgląd na rozpowszechnione podejrzenia o wpływanie podobnymi metodami przez Rosję na politykę innych krajów Europy i świata. Dla badaczy wywiadu, organów bezpieczeństwa i społeczeństw związek między służbami wywiadowczymi a dezinformacją stanowi poważne wyzwanie. Trudno jest częstokroć uczciwie odpowiedzieć na pytanie, kiedy zagraniczne służby wywiadowcze rozpowszechniają fałszywe informacje, a kiedy odpowiedzialni za nie są jednak inni aktorzy. Konsekwencje tego dylematu nie mają charakteru wyłącznie akademickiego, ponieważ decydują o tym, czy dezinformacja powinna być traktowana jako zagrożenie o specjalnych charakterze przez organizacje kontrwywiadowcze, czy też powinna być otwarcie dyskutowana przez inne instytucje społeczne, a nawet przez poszczególnych obywateli. W okresie zimnej wojny zarówno Wschód, jak i Zachód preferowały pierwszy wariant, choć w różnym zakresie.
Organizatorami wydarzenia byli: Instytut Pamięci Narodowej we współpracy z University of Southern Denmark (Odense, Dania), King's Centre for the Study of Intelligence, King's College London (Wielka Brytania); International Center for Defence and Security (Tallin, Estonia) i Ludwig Boltzmann Institute for the Research on Consequences of War (Graz, Austria). Dodatkowym partnerem tegorocznej edycji jest Institute for the Study of Totalitarian Regimes (ÚSTR, Praga, Czechy).
Relacja z konferencji na stronie internetowej IPN
3 września 2025 r., Warszawa – rozmowa z redaktorem naczelnym rocznika „Aparat Represji w Polsce Ludowej 1944-1989” dr. hab. Filipem Musiałem, przeprowadzona w ramach cyklu „Książki pełne historii”.
22–23 maja 2025 r., Kraków – konferencja naukowa „Polowanie na szpiegów! Kontrwywiad typu sowieckiego w Polsce i na świecie”.
Relacja z konferencji na stronie internetowej IPN


6–7 czerwca 2024 r., Lublin – międzynarodowa konferencja naukowa „Aparat represji – podmiot wykonawczy w systemie sowieckim – historia i perspektywy badawcze”.
Relacja z konferencji na stronie internetowej IPN


18–19 maja 2023 r., Kraków – ogólnopolska konferencja naukowa „Za kulisami bezpieki. Jednostki pomocnicze UB-SB na tle codziennego funkcjonowania aparatu represji PRL (1944–1990)”.
Program i relacja z konferencji

26–27 maja 2022 r., Kraków – ogólnopolska konferencja naukowa „W sieci zależności. Relacje Urzędu/Służby Bezpieczeństwa z innymi instytucjami Polski »ludowej« i tajnych służb państw bloku sowieckiego”.
Program i relacja z konferencji
27 maja 2021 r., Kraków – ogólnopolska konferencja naukowa „Służba Bezpieczeństwa w latach 1975–1990”.
Program i relacja z konferencji
Dyskusja wokół nr 20 (2022) rocznika „Aparat Represji w Polsce Ludowej 1944–1989”
Uczestnicy: dr Witold Bagieński, dr hab. Władysław Bułhak, dr hab. Mariusz Krzysztofiński, dr hab. Cecylia Kuta. Prowadzenie: dr Grzegorz Wołk
Dyskusja wokół nr 18 (2020) rocznika „Aparat Represji w Polsce Ludowej 1944–1989”
Uczestnicy: dr hab. Władysław Bułhak, dr Piotr Chmielowiec, dr hab. Adam Dziurok, dr hab. Filip Musiał, dr Paweł Skubisz. Prowadzenie: Rafał Dudkiewicz